Spesialistutdanningen er delt i tre. LIS1 er den første delen, med klinisk praksis først i spesialisthelsetjenesten og deretter i kommunen. Etter LIS1 skiller løpene seg.
De indremedisinske og kirurgiske spesialitetene har en felles del 2 (LIS2), med læringsmål som deles av en gruppe beslektede spesialiteter. Det gjelder for eksempel hjertesykdommer, lungesykdommer og fordøyelsessykdommer på den indremedisinske siden, og generell kirurgi, urologi og karkirurgi på den kirurgiske. I tillegg har hver spesialitet sine egne læringsmål i del 3 (LIS3).
De fleste andre spesialitetene har ingen egen del 2. Her går du rett fra LIS1 til LIS3. Det gjelder blant annet psykiatri, anestesiologi, ortopedisk kirurgi, fødselshjelp og kvinnesykdommer, og ASA-spesialitetene allmennmedisin, arbeidsmedisin og samfunnsmedisin.